Для обмена с сайтом, вы можете воспользоваться файлами в формате xml. Этот формат умеет обрабатывать 1С и средства, которые используются на стороне WEB. Все эти вопросы хорошо освещены в интернете. Если нужны какие-то подробности, то задавайте конкретные вопросы.