Могу посоветовать Worksection, так как сам его использую.
В нем задачи и подзадачи со сроками, с приоритетом для каждой задачи, тегами и статусами.
Управление пользователями позволяет создавать скрытые задачи и ограничивать доступ к определенным задачам другим участникам, ну и + обмен файлами, просмотр/редактирование документов непосредственно в системе (не нужно скачивать, редактировать и заливать обратно, можно делать все в режиме онлайн).
Попробуйте, должно понравиться.