Комбинировать, те что всегда загружаются на старте, явно нужно в один бандл. Если что-то тяжелое и используется редко, то подключать ассинхронно. Остальное можно разбрость пачками по модулям.
Так же ещё можно в первый бандл поместить самый минимум для отображения - что-б поднять первую страницу и следом бандл для нормальной работы.
Ещё можно все файлы ассинхронно, с анализом и последующим автобандлингом.
Вообщем можно по всякому, если у вас есть на это время.