В чём основной вопрос-то? Апач (возможно не сам, а РНР) у вас пытается выжрать больше памяти, чем ему может (или хочет) предложить ОС, поэтому запускается oomkiller и прибивает наиболее на его взгляд подходящее.
Подозреваю, что на хосте выдано виртуалкам памяти ненамного меньше общего объёма, поэтому периодически происходит ёк. В более-менее функциональных гипервизорах можно выключить балунинг памяти - тогда виртуалке будет сразу выдан весь объём.