Недостатки х86_64:

1) Выше потребление памяти(5-10%)
2) Больше места на винчестере из за установленных 32-х битных библиотек.
3) Память занимают еще и 32-х битные библиотеки.

Преимущества x86_64

1) В бинарных дистрибутивах(типа убунты) большая часть приложений собирается с совместимостью от i486 до i686. При этом там выключено большинство расширений процессора, типа sse и mmx. В Арче это не столь существенно т.к. сборка идет с i686, тем не менее разница все равно есть.
При использовании x86_64 системы все пакеты будут собраны с совместимостью с x86_64, что включает в себя куда больший набор расширений, к примеру sse2, что означает повышенную отзывчивость системы и заметное невооруженным глазом повышение производительности.
2) Не нужно использовать тормозные костыли типа pae.
3) На некоторых операциях, типа кодирования/декодирования видео/аудио прирост производительности будет очень существенный.

Как вы видите никакой особой разницы нет. Используя х86_64 вы выигрываете в производительности и теряете в памяти. Используя х32 — наоборот. Учитывая, что памяти у вас 4гб — я бы выбрал производительность т.к. её мало никогда не бывает.

Сказки про мифические глюки 64-х битных систем — просто сказки. Флэш давным давно совершенно нормально(насколько это вообще возможно для флэша) работает либо через nspluginwrapper, либо можно вообще использовать нативную х64 бета версию из адоб-лабс.
Всякие блобы, типа скайпа и гугл-земли, тоже работают без каких либо проблем, хоть и тянут за собой кучу 32-х битного мусора.

en.wikipedia.org/wiki/OpenCL

Openfiler — практически тоже самое, только основанное на линуксе, а не на фрибсд, а еще тут много непонятно зачем нужных(по крайней мере по умолчанию) в NAS'е вещей типа LDAP.
NexentaStor — практически тоже самое, только основанное на ядре Соляриса с gnu-окружением.
openmediavault — еще один линуксовый NAS.

Pulsar-OS — отличается тем, что находится в состоянии альфа-версии и как следствие глючит.

Open-E — у меня так и не захотело устанавиться, но судя по их сайту это что то крутое. Наверное.

Zentyal — крутая штука, но там СТОЛЬКО лишнего… Например voip. И еще много всего. Очень много всего.

Собственно, если ваше оборудование поддерживается любым из этих трех ядер — то по большому счету особой разницы нет. Опенфилер пожалуй малость требовательней к ресурсам.
Лично я бы выбрал опенмедиаваулт т.к. он линукс-базед и как следствие привычней и там меньше лишнего по сравнению с опенфилером.
Кроме того достаточно любопытный выбор это Nexenta, в первую очередь из-за поддержки zfs.

А если вам хочется чего то особенного — можете взглянуть на gluster ^^