Файлы удаляются через Remove-Item.
Я бы написал так. Но, как справедливо указал
Владимир Коротенко, на свой страх и риск :)
$PathIn = "\\Server\files"
Get-ChildItem -Path $PathIn -Filter UVHD-S*.vhdx | Where-Object {
$User = Get-AUser $_.BaseName.Substring(5);
$User.Enabled -eq $false
} | Remove-Item -Whatif
И ещё, как минимум, стоит себя обезопасить и удалять не просто отключенных, на уже давно отключенных, например с просроченным паролем.
То есть вам надо будет доработать часть
$User.Enabled -eq $false