C# — всего лишь язык. «Грамотность» кода зависит от технологии. То, что хорошо для WinForms, — смерть для WPF.
Поройтесь в Microsoft'овских проектах на Codeplex. Не рискну сказать что там «грамотный» код, но, как сказала одна героиня Lie to me, «Если ты в постели „средне“ — значит ты уже лучше многих».

В Zune используется Microsoft UIX Framework (C++), он же используется в Windows Media Player и Windows Media Center. Естественно, для Zune он кастомизирован из-за другого дизайна.
Под WPF могу посоветовать свой проект :) http://elysium.codeplex.com/releases/view/74903 Подождите недельку до следующей версии и будут доступны «плюшки» типа Application bar и Toast notifications.

Как уже сказали выше, с Join() ничего работать не будет, т.к. вы ждёте завершения потока.
А вообще посмотрите в сторону асинхронного программирования и класса BackgroundWorker.
msdn.microsoft.com/en-us/library/ms228969.aspx