Всё зависит от условий использования, используете много файлов - решает IOPS, если же файлов мало - хватит и одного/двух дисков.
Ну и естественно на линке 1Гбит/с выше 125мб/с не получится, либо агрегировать 2/3/4 1Гбит линка, либо 10Гбит /с надо
crs226 не роутер, это l3 свич и файрвол очень сильно грузит его, идеальным вариантом будут access порты на crs226 и trunk на что-нибудь более мощное хотя бы rb750(G)r2/r3.
В вики микротика есть достаточно понятная инструкция по настройке vlan, лучше читать на английском языке, будет понятнее wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:CRS_examples#VLAN