Alexey Dmitriev

Посмотреть даты создания пакетов в репозиториях, там лежат несколько версий

Если приложение умеет работать через любой proxy сервер, установить любой proxy сервер, повесить его на нужный вам интерфейс и настроить приложение на работу через proxy.
Если приложение подключается к конкретным портам или ip адресам - можно настроить маршрутизацию, используя iproute2.

Такая "трабла", как и большинство других - решается поиском ошибок в соответствующих логах и их устранением.

Есть же информация об ошибке "nginx: configuration file /etc/nginx/nginx.conf test failed".
Запустите nginx -t - покажет строку с ошибкой.

Нужно настроить SELinux, есть специальный man - httpd_selinux(8)

https://bestpractical.com/request-tracker

Нет, нельзя. Если человек имеет доступ к сайту - он сможет по стандартным механизмам скачать и файлы и базу.
Нужен другой подход - например CI\CD

После создания физического или виртуального подключения нужно обеспечить 2 вещи:
1. Корректную маршрутизацию на каждом узле сети - каждый узел (включая источник и получатель) по пути следования пакета должен понимать, куда маршрузитировать исходящий пакет и куда отправлять ответный.
2. Прохождение пакетов, которое состоит из двух вещей - наличие разрешающих\отсутствие запрещающих правил файрвола и разрешение на прохождение пакетов между сетевыми интерфейсами - в linux это через включение net.ipv4.ip_forward в sysctl, в Windows - через RRAS службу.

1. Другие пользователи (кроме root) не смогут достучаться сюда /root/.nvm/versions/node/v16.18.1/bin/
2. Чтобы изменить приоритет поиска программы - добавьте после установки nodejs в директории пользователя в PATH в /home/user/.bashrc на первое место /$user/.nvm/versions/node/v16.18.1/bin/
Тогда сначала node будет искаться там а затем уже в /usr/bin/
Или используйте механизм update-my-alternatives для выставления нужных приоритетов и создания алиасов

1. Собрать их исходников в /usr/local.
2. Обновить Ubuntu 18.04 до 20.04 или 22
04.
3. Не трогать glibc ибо это основа системы и решать проблему другим путем

Нужно сходить в гугл, спросить "how to resize ext4 from windows" и попробовать варианты.

Отключите использование netplan в Ubuntu

Ничего странного в логе нет - нормальные ошибки в логе при данном конфиге postfix.
Он просто не настроен на прием входящей почты для какого-то почтового домена.

Git конечно. Хранить в репо и делать Git pull на машинах по cron

Идете в google, вбиваете performance monitor linux, выбираете подходящую утилиту, например Collectl, настраиваете и ждете всплеска. Потом анализируете полученные данные.

Видимо упираетесь в какие-то лимиты типа "client_max_body_size" и т.п. в настройках php и/или веб сервера. В какой - могут подсказать соответствующие логи, возможно нужно повысить уровень логгирования\включить debug

Мысль вслух - замените это "Samba настроил (архив фотографий и т.п.) доступ со всех устройств своих и даже издалека" на NextCloud.