Sanes

На сервере с файлом должен быть веб-сервер или ftp.

я хочу обновиться до последней версии

Обновляйся. Если заняться больше нечем.

Что-то вроде update-grub должна найти все ОС на дисках.

Ставьте минт. Но сама идея так себе. Если только пару дней побаловаться. Желательно на виртуалке.

Ace плеер умеет стримить торренты.

Можно. Даже Virtuozzo/OpenVZ 7 версии взлетит. KVM вряд ли будет работать, хостеры обычно отключают вложенную виртуализацию.

Добавьте нового пользователя и запускайте скрипты от его имени. PHP-FPM в помощь.

LXC сильно ограничен, но может подойти. Пробуйте развернуть сервер в контейнере и лучше в LXD (там есть rest-api).
Если будут проблемы, следующим шагом я бы пробовал на OpenVZ/Virtuozzo.
И уже потом виртуализацию на уровне железа (KVM/Vmware/etc.).

Панель управления хостингом это называется.

Режимов работы PHP много. Изучайте каждый.
Я лично предпочитаю Nginx+Apache+PHP-FPM.
Есть еще без апач, там только PHP-FPM, есть с апач. Там и режим mpm-itk и mod_ruid2 и CGI/FastCGI.
Самый кривой и неправильный Apache Prefork mod_php

Можно сразу комбайн поставить типа Zentyal или ClearOS. Или обойтись какой-нибудь хостинговой панелью, выпилив от туда ненужные модули.
Беслатный почтовый сервер честно говоря не встречал, так, чтобы вам с конфигами сильно не страдать.

Есть. На серверах обычно стоят.

Этот ноутбук даже браузер не потянет. Выкинуть его лучше. Нервы поберегите.