Потому что у вас логика работы программы неверная в принципе.
Скажем, вы ввели букву 'у'. Ваш код выполнит проверки:
'л' === 'у'? нет.
'л' !== 'у'? да. Вывод сообщения 'Вы не угадали букву'.
'у' === 'у'? да. Вывод сообщения 'Вы угадали букву: у'.
'ч' === 'у'? нет.
'ч' !== 'у'? да. Вывод сообщения 'Вы не угадали букву'.
Сообщение должно выводиться по результатам проверки всех букв слова, а не для каждой буквы.
Уже угаданные буквы надо исключать из проверки.