Для сферической игры в вакууме, я бы начал делать сохранения после того, как сделал меню, чтобы как можно раньше реализовать полный цикл приложения. Никто мешает вам в отдельных тестовых сценах/проектах продолжать работу над геймплеем, и никто не заставляет вас сразу сохранять все механики. Но, по крайней мере, вы сразу задумаетесь о том, какие переменные может понадобиться сохранять, а это заставит вас соответствующим образом поменять архитектуру, что сделает ваше приложение более гибким. А "кучу идей" в любом случае не стоит пихать в основное приложение, эксперименты с механиками не должны ломать стабильное состояние игры. Интегрировать механики с сохранками имеет смысл только после их утверждения.