Pavel K

Как по мне, таблицы лучше верстать таблицами...
По-моему универсальных советов нет, ко мне это пришло просто с опытом и с логикой...

По ссылке если уж верстать дивами, то каждая эм "новость" - див, в диве ещё два, один из них под дату, другой под текст. Иначе если Вы будете делать сайд-баром (отдельный див я так понимаю во всю высоту и рядом отдельный див под текст) то проблематично будет их выровнять что бы даты начинались там же где и контент по высоте, если не фиксированным делать.

Заголовок в див, ниже поля recent search и тд ещё в один див.

Див с классом "tooltip fade left in" в нём проблема.
По-моему что-то с позиционированием (margin) внутренних либо ещё что-то в этом духе.
По-моему проще будет ему по умолчанию в стилях задавать visible: hidden, а после прогрузки в скрипте, где он применяется задавать нужные стили.

Для начала стоит прояснить, какая аудитория у сайта - может проще сам сайт сделать более понятным и простым?
Тогда почти для всех не понадобятся всякие инструкции и подсказки.
Лично меня подобные "тыкни сюда получишь то то" просто выбешивают, особенно если нельзя пропустить.

Потому что у Вас в стилях для блока header

header {
   height: 685px; 
}

А блоки с иконками и блок с оказываемыми работами находится в нём.