У меня вот так сто лет назад настроено, работает.
server {
listen 8379;
server_name _;
root /usr/share/phpMyAdmin-4.9.4;
index index.php;
access_log off;
error_log /var/log/nginx/phpmyadmin.error.log;
location ~ ^/(.+\.php)$ {
fastcgi_pass unix:/var/run/php/php7.2-fpm.sock;
include fastcgi_params;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
}
}
Открывается через свой порт
mysite.com:8379
В Вашем варианте не указан каталог, где лежит скрипт PHPMyadmin и не указано, кто его должен исполнять.