АртемЪ

Если вам по каким-то причинам явно нужна именно ExtFAT и вы четко знаете для чего - используйте ее.
Во всех остальных случаях - NTFS.

На десятке точно не подскажу мало еще ее ковырял, но принцип тот же как и всегда.
На системном томе включить теневое копирование - в случае проблем откат к предыдущей точке.
Бэкап пользовательских файлов на защищенный от записи пользователем диск.
На случай если произойдет сбой - флешка с стандартной установочной средой на базе WinPE и интегрированный туда TeamViewer позволит вам удаленно подключиться даже в случае если windows не загружается и удаленно исправить или переустановить систему.

В компонентах выключил hyper-v.

Ну если вы ее выключили с чего она должна быть включена?

Какой протокол подключения наиболее быстрый для удалённого рабочего стола?

Самый быстрый - RDP. Именно нативный когда подключение идет с Windows на Windows.
Все остальное заметно хуже.
Под линукс есть целый зоопарк таких клиентов - но все далеко от идеала. Куча разных клиентов и серверов разной степени стабильности, которые в одном случае неплохо работают, в другом вообще не работают.
С линуксом лучше общатся по ssh - быстро, удобно и все что нужно.

Вопрос стоит в том, какой из протоколов для подключения использовать, чтобы минимизировать задержку?

Задержка в основном зависит от пинга между хостами, и мало зависит от протокола.

Как сделать бэкап раздела восстановления?

Любой программой умеющей делать копии дисков и разделов. Например акронис, или клонзилла.

А так же интересует вопрос...нужен ли ключ активации для того, чтобы лицензия сохранилась ??

Лицензия это разрешения правообладателя на использование его продукта. Может быть в письменной или устной форме. Обычно манипуляции с разделами диска никак не затрагивают лицензию хранящуюся в шкафу у юриста. Поэтому восстанавливать ее не придется, если конечно юрист ее не потеряет.

Ключ активации - это программное средство отключающее механизм защиты от нежелательного использования.
Нужен он тогда, когда этот механизм мешает работать. К лицензии никакого отношения не имеет.

Если вас интересует вопрос сохраниться ли активация windows - при полном копировании разделов, и при условии что вы не будете менять конфигурацию железа, она разумеется сохранится.

Резервная копия защищает данные от уничтожения.
Вот например диск сгорел - а резервная копия целая, потому что она не может размещаться на этом же диске.
Резервная копия имеет гарантированный срок хранения, и уничтожается тогда, кода есть резервная копия более актуальных данных.

А история это просто история.
Функция файловой системы позволяющая сделать снимок файловой системы и потом в любое время восстановить его.
Она хранится на том же диске, под нее выделено.некоторое пространство, как только оно закончится, более старый снимок удаляется, если это не поможет могут удалится все снимки.
Вот например начнете вы восстанавливать из этой копии данные на этот же диск - место закончится, и копия удалится автоматом.

У истории файлов нет преимуществ перед резервным копированием по той простой причине что это разные вещи.

Бэкап создается долго минуты, а то и часы и сильно грузит компьютер- попробуйте скопировать большой массив данных.
История файлов базируется на теневом копировании - снимок всех файлов на диске создается мгновенно вне зависимости от количества данных на томе и размера тома, и практически не потребляет ресурсов системы.
Можно делать теневые копии хоть каждые десять минут.

Теневые копии это отличный инструмент для резервного копирования.

Ну и так в работе полезно.
Удалил файл, вроде ненужный.
Потом вспомнил что он вроде как нужный - полез достал из теневой копии.
В бэкапе его нет - бэкап делается один раз в день, а этот файл я сегодня создал и сегодня удалил.
Пользователь случайно грохнул все файлы на файловой шаре.
Зашел восстановил все из теневой копии.
Причем это сделать может и сам пользователь.
Если восстанавливать из бэкапа - потеряется день, теневая копия у меня на файловых шарах делается один раз в час.

На втором скриншоте внизу ссылка - монитор ресурсов.
Открываете ее, переходите на вкладку Диск, там смотрите в какой именно файл идет запись.
Ну и уже будет ясно что это за файл, и нужно ли с этим бороться.

Если откатывались - значит есть теневая копия.
Найти теневую копию, смонтировать - восстановить все файлы с нее.

Ну если что-то запускается, значит кто-то запускает.
Открывайте планировщик и ищите задачу которая запускает его.