Вставляете новый диск в ПК, разбиваете его как Вам надо на разделы, форматируете в нужные файловые системы
Вставляете второй диск - пустой, такой же
Заходите в винде - управление дисками, выбираете там объединение дисков, RAID1
Всё... ждем пока закончится синхронизация
Или вначале объединяете их в райд, потом разбиваете на разделы уже полученный рейд массив. Без разницы
Лучше рейд делать в вашем случае на винде, это надежнее чем на чипсете материнки
Да, новая винда должна будет подхватывать этот рейд по идее
Только не понятно зачем разбивать диск на разделы, когда можно просто в корне создать нужные папки....