Возможно, лучше использовать примитивы
GameObject cube = GameObject.CreatePrimitive(PrimitiveType.Cube);
и уже его резать на меши. тогда нормали 100% в порядке будут.
After Effects не поддерживает полноценную работу с 3D пространством, поэтому экспортнуть в него не получится.
Есть вариант использовать Element 3D, и импортировать всё туда.