Хочу поинтересоваться, могут ли быть какие-нибудь проблемы?
Могут. Сам не так давно обновлялся и возник вопрос, который не так-то легко гуглится.
Вот тут описал суть проблемы и ее решение, прочтите обязательно перед обновлением.
esxi установлен на массив с vmfs разделами
Вам конечно виднее, но я бы рекомендовал поставить сам ESXi на карту памяти или флешку для разделения гипервизора от данных (в некоторых серверах есть разъемы на материнке под SD). Это позволяет не думать о возможности неверной разметке при реинсталле. Ну и если что-то случится - форматнул и накатили по новой, благо это занимает буквально полчаса вместе с добавлением виртуалок и настройкой сети.