А при перекручивании в другой корпус, стойки крепления лишние случайно не остались под платой для которых не совпали отверстия?
Это наверное самая частая ошибка при пересборке в другом корпусе.
Ну так Windows Boot Manager и должен загружать Windows 11.
И в загрузочном меню с выключенным CSM не должно быть никаких дисков, а только список доступных UEFI загрузчиков.
Обычная проверка файловой системы все восстановит.
Нечто подобное пару раз наблюдал когда из под другой ОС записывать данные на диск, а потом они в основной системе находящейся в гибернации или с использованием быстрой загрузки были невидны.
Практически любой Linux больше 10 лет точно поддерживает загрузку и установку в UEFI.
Как минимум еще в 2013 году последнюю на тот момент Ubuntu Server ставил в UEFI на домашний сервер.
Обратитесь в специализированный СЦ.
Самостоятельные попытки его реанимации дома без должных знаний и опыта скорее приведут к еще большему ухудшению его состояния и существенно снизят шанс успешного восстановления данных.