с вашим подходом можно решить только задачу, чтобы они работали последовательно.
если задача, чтобы второй скрипт досрочно завершил работу, то нужен
семафор (скрипт работает).
Можно проверять существование определенного файла и если он есть, то выход.
Но не забываем, что из-за ошибки файл семафора может не удалиться по завершению скрипта.
Как вариант имя зависит от даты и текущего часа. В этом случае при сбое, на следующий час исполнение автоматически продолжиться.