юзал флешки для системы, тут важен вопрос оптимизации работы, отключение логов, перенос всех часто читаемых файлов на нормальный диск.
Без оптимизации почти все флешки умерли в течении полугода(штук 10 было).
Считаю первый и третий вариант не слишком надежными для использования в качестве системного диска. Основное слабое место флеш-памяти — количество циклов перезаписи.
Из предложенного лучшим решением будет SSD.
Почему нельзя флешки на системный диск ставить?
Мне кажется это вполне нормальное решение, по умолчанию все монтировать в риадонли, при обновлении пакетов или чего там будет перемонтировать с возможностью записи. Разделы требующие записи монтировать с оперативки(сейчас она не дорогая и вполне можно отвести 500 метров под всякие нужды)
Я бы юзал флешку и не парился. Логи на домашнем сервере для фильмов-музыки — нафиг не нужны.
А следовательно обращений к ней и будет только что при загрузке, да при обновлении.