По личному опыту советую тебе тот ВУЗ, где сильнее дают математику. Вот чтобы прям кровь из глаз лилась и уши заворачивались от крутости математиков ВУЗа. В этом случае криптография будет для тебя любимым делом.
Я в свое время (2008) поступал в Бауманку на ИБ, но первую волну абитуры отсеяли, и я пролетел. Поехал учиться в Питер. Стал по диплому математиком (090102.65). Не могу сказать, что я гуру криптографии и математики, но могу ориентироваться почти свободно в математическом аппарате протоколов. Теперь поступаю в аспирантуру по профилю :)
Говорят, академия ФСБ хороша в этом вопросе еще. Там, вроде как, специальность 090101 (криптография) дается.