BitLocker To Go + GPO + certificate protector из доменного PKI — это рабочая схема именно для твоего кейса.
Флешка шифруется и добавляется certificate protector:
manage-bde -protectors -add X: -Certificate -ct <thumbprint>
. GPO деплоит этот сертификат (с приватным ключом) на все доменные машины через autoenrollment — при подключении Windows автоматически ищет ключ и монтирует без запроса пароля. За пределами домена сертификата нет, данные недоступны. Чужие флешки отрезаются политикой "Deny write access to removable drives not protected by BitLocker".
Из готовых решений: DeviceLock или Endpoint Protector (ранее CoSoSys) — они специально под такой сценарий, whitelist корпоративных устройств + auto-unlock в домене + блок всего остального, всё в GUI.
p.s. EFS не подойдёт — это файловое шифрование, привязки к домену в нужном смысле нет.