Заметной просадки по скорости между 5400 и 7200 не будет. Пара-тройка мегабайт погоды не сделает, когда HDD пингует (в смысле, позицонирует головку и дожидается начала, и снова позиционирует головку и дожидается продолжения) до секунды без проблем.
По часам, в любом случае потеряете где-нибудь до часа-двух автономной работы. Если всё остальное так же прожорливо, пожет быть потеряете часа пол. В общем, 10-20% автономной работы. 5400 сэкономит пару процентов, не более. Но зато он более устойчив к внешнем воздействиям, намного менее шумный и это уже намного интереснее.