Что у вас тормозит? сам браузер или управление?
Пишите приложение на вашем любимом языке программирования и используйте вебконтролы - .net - WebBrowser, mono - firefox, jawa и другие - WebKit, еще есть на базе chromium
В этом случае работаете напрямую со страницей минуя посредника. В 99% случаев достаточно просто инжектить javascript на страницу.
p.s. избавиться от браузера можно - если реверсить протоколы веб-приложения и симулировать его запросы с помощью curl но это бывает заметно сложнее (а почти невозможно).