Андрей Не важно, API - это то, что предоставляет сам ВК.
Если сторонний сайт предоставляет "свой вк апи", то он, скорее всего, предоставляет обертку над стандартным вк апи, примешивая свои функции. Никакой разницы с тем, что будешь использовать прокси.
Откуда предполагается использовать апишку?