VDSmanager - уже несуществующий продукт (на офф сайте ссылки на него нет).
VEmanager - там под капотом OpenVZ.
VMmanager - там под капотом libvirt (а значит Xen или KVM).
Что лучше - вопрос, на который однозначно ответить нельзя. OpenVZ хорошо оверселлится, но хреново работает в целом. Технари давно стараются избегать таких виртуалок. KVM/Xen работают лучше, предоставляют куда больше возможностей клиентам, но там не получится оверселлить.
Из-за чего повышенное потребление памяти на VPS? - вопрос из области Openvz vs не-openvz с точки зрения клиента.