По опыту сталкиваюсь в лучшем случае с hp-ux, в остальных случаях поголовно с линуксами (debian\rhel\centos), доминирует rhel в моем случае среди линуксовых. А так на практике большинство серверов на окнах и пара на линуксах. Загвоздка в том что зачастую на этих самых паре серверов конкретный ад из тонн скриптов и самописного софта, причем еще и ОС далеко не первой свежести. Опять же в моем случае это пара десятков rhel 6, из общего зверопарка всего 2 сервера на hp-ux которые пашут на itanium и на которых крутится крайне проприетарный софт alcatel-lucent.
Так к чему я все это, знания именно linux (ок, gnu\linux если у кого табуретка прогорела) важнее т.к. разношерстнее, в случае с окнами и , в моем случае, hp-ux(unix) все проще(если легально), есть тонны дотошных многостраничных мануалов в которых можно найти почти любую проблему.
PS, мнение исключительно мое и вероятно крайне не совпадет с другими в других сферах где правит прогресс технологий, а не суровый замшелый энтерпрайз с бородатыми начальниками которые отталкиваются от опыта работает зачем менять.