Как это будет всё выглядеть в системе?
Как установите, так и будет.
Можно объединять, причем разными способами, при желании даже ярусный массив создать.
Делается либо из менеджера дисков, либо из панели управления дисковыми пространствами.
Они между собой будут нормально работать?
А чего им между собой работать? Система с ними работает. Можете хоть сотню дисков подключить.
SSD 2,5 пару штук гиг на 400-500 поставлю как для файлов
А какой смысл? Что за задача такая, что нужны SSD да еще и на 2,5. Почему именно два на 500, а не один на 1000? И вообще зачем вам три SSD в системе?