Подождите, префикс r — это просто синтаксический сахар, а не какой-то особый тип строки. r'abc' для интерпретатора — это не "r-строка", а просто указание заэкранировать все спец-символы и сочетания символов и вернуть результат в виде обычной строки. Которую можно сохранять в JSON, загружать из JSON'а без потерь.
То есть, если мы пишем r'a\nb\tc' — это то же самое, если бы мы написали 'a\\nb\\tc'
Другими словами, вам достаточно только сохранить данные в JSON с указанием префикса r. После этого их можно загружать обратно из JSON'а с полной уверенностью, что вы ничего не потеряете