В одной из компаний, которую я консультировал, использовали
TeamLab и на меня эта система произвела самое приятное впечатление.
Сам сейчас использую
ASANA, но там очень скромный функционал.
Также мне кажется перспективной связка MindMaps + ToDo в исполнении
MindJet