Из коробки этот поиск по содержимому файлов может работать только если на сервере установлен sphinx и подключён в настройках модуля поиска по сайту. Но я не уверен что он сможет искать по содержимому PDF-файлов. Для этого скорее всего потребуется доработка, вот в этой статье есть некий пример -
https://habr.com/post/131089/.
Если сайт работает на bitrixenv, то sphinx устанавливать не нужно, достаточно включить его в настройках сервера и произвести индексацию.