В общем, без разницы.
был в индексе поисковиков и стоял и не отвечал на их запросы, так как хостинг был отключен. То есть мне кажется что у него плохая репутация
Dias Oral, репутация — это другое.
Если этот домен понижался в поиске за нарушение правил или вы спамили с него, тогда это плохая репутация и проще зарегать новый (если, конечно, не теряете уникальное красивое имя).