Если не Git (а правильно таки git, но мало ли что у вас там с хостингом), то есть инструменты для деплоя по FTP. В том же phpstorm есть.
Совсем для ленивых, тупой вариант - берем FTP клиент, например Filezilla, открываем директорию с проектом на сервере, копируем в нее файлы проекта, Filezilla спросит что делать с совпадающими файлами, выбрать вариант "заменить если отличается размер и дата изменения"