Физическая модель - это практическая реализация логической модели. Например, в физической модели описывается наличие связи M:N между двумя сущностями, без детализации, как она будет реализовываться, а в физической вместо факта наличия связи появляется её реализация с использованием, например, связующей таблицы. Или JSON-массива в ведущей таблице. Связь между тремя сущностями может реализовываться одной связующей таблицей А-В-С, а может в одной таблице связываться А-В, а в другой (АВ)-С. И так далее.
То, что вы приводите на первом скрине, логической моделью уже не является, там вы уже наполовину конвертировали её в физическую. Отсюда и удивляющая вас похожесть.