Ну можно попробовать так:
1. При установке выносим /home в отдельный раздел.
2. Копируем содержимое /home в какой-нибудь дропбокс
3. Раздел отмонтировываем (umount)
4. Монтируем другую папку какого-нибудь дропбокса в /home
Вижу следующие возможные проблемы:
1. Не безопасно
2. Если версии ПО будут отличаться дома или на работе, то конфиг приложений может быть разный, поэтому что-то может отваливаться (при работе с ПО).
Лучше просто завести какой-нибудь дропбокс для общих файлов, а не всего раздела или иметь live дистрибутив, запускать его с флэшки, где на флэшке и будет /home раздел (может работать медленно)