Не нужно использовать весь функционал, даже наоборот добавить тот, который нужен под данный тип деятельности!
Попробую угадать: у вас возникло желание внедрить небольшую самописную ERP/CRM/(другие модные аббревиатуры), и вы почему-то решили начать этот процесс с выкидывания 1С и написания велосипедов.
Хотя логичнее писать и внедрять новую систему, пополняя ее данные выгрузками из 1С, и отказываться от последней только тогда, когда (и если) ее ненужность действительно станет очевидной. Скорее всего - никогда...