подождите, там только линии или и обводка имеется?
Вы удалили лишние обьекты после экспанд эпириенс?
возьмите рядом нарисуйте просто две линии. одну обычной линией с толщиной, скажем, 2пт, и вторую такую же с обводкой и экспадните ее. что в пдф покажет?
еще гляньте в альтернативном просмотрщике, например Foxit. Так Вы узнаете чья проблема - может у Вас там толщина ~"хейрлайн" и акробат ВЬЮЕР так ее отображает на выводе.