Нужно копировать файлы применяя файл исключения ignor.list
ignor.list содержимое файла
3.mp3
4.mp3
6.mp3
Чтобы получалось вот так
dir1 dir2
1.mp3 1.mp3
2.mp3 2.mp3
3.mp3 5.mp3
4.mp3 7.mp3
5.mp3
6.mp3
7.mp3
Есть еще подводные камни в названиях файлов например (DJ KUBA-NE!TAN - Party On!.mp3, DAVE ARMSTRONG - Make Your Move (Part 2).mp3, LMFAO - Sexy & I Know It.mp3, QUINTINO-CHEAT CODES - Can't Fight It.mp3)
Благо список ignor.list небольшой и редактирую вручную и заносить записи такова вида непроблема (LMFAO\ -\ Sexy\ \&\ I\ Know\ It.mp3)
p.s. Применять можно любые средства cp, find, rsync, скрипты, главное чтоб выполняло задачу