Есть плагин PowerCursors. В нем нужно немного разобраться с горячими клавишами, он как раз позволяет добавлять, удалять и даже вроде изменять отдельные мультикурсоры.
в sublime сам с такой проблемой столкнулся - решения не нашел, перешел на VS Code, там выделение через alt+лкм, а отмена последней операции ctrl+u и все работает.