На Windiows включаете механизм защиты системы, и настраиваете штатный бэкап
Если вирус систему не положил наглухо - поможет откат, иначе из бэкапа восстановите, в принципе недолго.
Второй вариант - загрузка не с реального диска, а с виртуального. Т.е никакой виртуализации, обычная система но грузится с файла VHD.
Восстановление к исходному путем замены файла на оригинальный.