1. bash-скрипты в разы удобнее .bat скриптов. powershell тут не в счет, это отдельная тема.
2. При администрировании парка из разных машин, ты можешь это делать теми же скриптами
3. MS потихоньку влезает в гонку за серверами, а для этого очень неплохо предоставить привычное окружение и работу известных всем команд, которые распространены в текущем серверном лидере - *nix
4. Возможность нативно запускать программы, которые были написаны для Linux. не все, не легко, но уже сейчас многие просто работают. А это очень много программ. Под Линукс вообще нетребовательных и крайне полезных утилит - просто море.
5. Если допилят штатный sshd, это будет вообще крайне удобно. Наконец будет кроссплатформенный, защищенный и гибко настраиваемый способ передачи данных и управления из коробки.
Ну и так далее.