Однозначно лучше бокс + ноутбучный HDD! И вот почему:
1. Бокс очень дешев - я видел на Али дешевле 300 руб, и это под USB-3.0 (кстати, покупать под USB-2.0 уже не имеет смысла). А цельные внешние HDD под USB-3.0 встречаются пока куда реже.
2. Новый ноутбучный HDD даже с добавлением стоимости бокса всё равно дешевле, чем цельный внешний HDD, поскольку производится куда большей серией.
3. Можно приобрести один бокс и в него заряжать много разных HDD, тогда его цена, делённая на их количество, вообще перестанет иметь значение.
4. С ноутами такое дело - бывает, наступят на экран, или ещё что-то подобное. В этом случае HDD вообще достаётся на халяву, и USB-диск вы получите, купив только бокс.