Гы.
Так это зависит что у вас на той стороне стоит, то есть что именно на сервере.
Если скажем у вас там на сервер стоит специализированное ПО Flynn.io (рекомендую, он все за вас сделает), то все делается элементарно через git, да.
Если же у вас там на сервере вообще ничего не настроено, то толку от того, что вы любым способом скопируйте свой код - автоматически он работать не будет.