Используйте не реле, а полевой транзистор и ШИМ. Это позволит плавно наращивать ток в двигателе, увеличивая коэф. заполнения ШИМ.
![%D0%BA%D0%BE%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%B5%D0%](http://wiki.amperka.ru/_media/%D0%BA%D0%BE%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%B5%D0%BA%D1%82-arduino:9_mixer_scheme.svg.png)
Если ардуина запитана от 12В, то можно немного смягчить
симптомы, подключив её
через диод, а за ним уже конденсатор по питанию ардуины, поближе к самой ардуине... (обведено красным)
![35781f484aaa40adbcabaf2b6ede7145.JPG](https://habrastorage.org/files/357/81f/484/35781f484aaa40adbcabaf2b6ede7145.JPG)
Так же есть вариант, что у вас ардуина подключена напрямую к обмотке реле и это она уходит в кз при попытке открыть реле :)
Либо при пуске двигателя возникает мощная наводка, если он близко лежит.
Используйте ступенчатый запуск на двух реле! Сначала подключать реле с мощным токоограничительным резистором (от того же ВАЗа), потом включать второе реле, которое исключит этот резистор,
хотя это уже прошлый век это решение проверенное временем!