Ну до кучи к выше сказанному - проверьте ваши скрипты, есть вероятность что они начали выдавать в ответ что-то не то что ожидает PayPal - 500, 404, php_error, BOM, etc.
Проверить можно по логам - или error_log или длины ответов в access_log (не стали ли ответы длиннее обычного).
Это все актуально, если PayPal не менял свое api и не ожидает от ваших скриптов чего-то иного.