Есть второй жёсткий (на который следует перенести инфу), в комп можно подключить всего 2 жёстких.
Значит, исходно у вас только один диск.
диск, с которого надо перенести информацию, не является системным.
Следовательно, вы ведете речь не о целом диске, а о пользовательском (несистемном) разделе диска. Но поскольку глюки диска вряд ли остановятся на пользовательском разделе, пощадив системный, надо менять весь диск.
Т.е. простым копированием данных тут не обойтись, надо клонировать диск, пока это ещё возможно.