Если /home находится на отдельном разделе, то файлы на нём не будут тронуты (если только не отформатировать раздел при установке).
Просто убедитесь, что НЕ стоят галочки в колонке "Format" на разделах, файлы на которых вы не хотите терять.
ну так же ж перенести данные из home на примонтированные диски, а потом назад их примонтировать после переустановки и обратно переместить в хоум всё... странный вопрос
А какие данные могут потеряться, если home примонтирован в home? Если не переразбивать разделы и не монтировать / в старый /home, то и данные не пострадают. Возможно я не так понял вопрос, но не вижу проблемы.