IANAL, TINLA.
Недостаточно данных для осмысленного ответа.
> начать разработку системы с нуля, но при этом сделать адаптеры API от старой версии системы.
Важно не что́ вы собираетесь сделать, а что́ при этом намерены использовать из об’ектов монопольных прав вашего «текущего вендора» (что бы ни скрывалось за этим странным словом).
Вероятно, волне возможно не использовать элементы принадлежащих ему программ и его товарные знаки, и в таком случае вы не будете связаны авторскими ограничениями и ограничениями на средства индивидуализации. Если вы находитесь в бывшем Советском Союзе, то вы, вероятно, не можете быть связаны и патентными ограничениями.
> необходимо ли получать какие-то лицензии на SOAP и REST/JSON от текущего вендора?
В любом случае, я дико сомневаюсь в том, что если вы все-таки намерены использовать что-либо, то вам дадут такое разрешение.