Могу предположить, что эти два "набора" различаются по таймингам, ещё как вариант - различается кол-во микросхем на планках, или исполнение - одностороннее/двустороннее (может влиять на скорость опроса банков памяти).
Выход один - либо настраивать через BIOS тайминги (если есть такая возможность...), либо замена всей памяти на планки от одного производителя (что ИМХО предпочтительнее - делать "винегрет" на материнке, это, мсье, признак "дурного" тона либо поползновения в сторону нищебродства)... Разные цвета разъёмов показывают что планки памяти на данной материнке могут работать в канальном режиме!
ПыСы: Попробуйте запустить пары от одного Производителя по отдельности, последовательно по обеим парам разъёмов памяти на материнке! Нельзя исключать вариант что сбоит какая-то из планок или разъём памяти на материнке... Также было бы неплохо сделать прогон MemTest-ом! Если будут ошибки - то с результатами тестов гоу в магазин, пока память на гарантии.!